定期清洗船舶燃油舱安全有效的方法是安排船舶进坞彻底检查和清洗，短期内安排全球所有正在使用HSFO的船舶进船坞清洗燃油舱并不现实。建议会员船东还应尽早安排船舶油舱清洁的各项工作，以满足即将到来的2020全球限硫新标准。目前大多数船舶使用的仍是高粘度高硫燃料油(HSFO)，此类燃料油会粘附在油舱内壁上，非常难清洁。
清洗方法所用时间是基于航运实践的经验总结，并不一定适用于每一船舶。IMO也表示，船舶为满足0.50%m/m含硫量上限而备舱所需的时间和工作量难以预估。船舶进入船坞进行燃油舱清洗所需要的时间因船而异，但一般来说每个燃油舱清洗的平均耗时为2-4天，再加之对船舶燃油系统管路的冲洗。建议会员船东还应尽早安排船舶油舱清洁的各项工作，以满足即将到来的2020全球限硫新标准。
一些航运公司在更换使用燃油舱之前会使用化学添加剂进行清洗。实践证明，这是减少清洗油舱非常有效和经济的方式之一。指南中重要的一个技术环节就是关于船舶在开始使用含硫量低于0.50%m/m的合规燃油前的燃油舱清洗问题。冲洗船舱的灰土、船舱垫尘、油污等产生的废水，该类废水属于含油废水或含有一定毒性液体的污水。
每艘船彻底完成清洗和冲洗需要的时间大约为1-2周。经过上述彻底清洗和冲洗的油舱和管路，在接收合规的燃油后，基本可以满足公约的排放要求。建议会员船东还应尽早安排船舶油舱清洁的各项工作，以满足即将到来的2020全球限硫新标准。进入程序必须遵守国际海事组织第A.1050(27)号决议关于《进入船上密闭舱室的建议案》中的安全措施。