木制托盘的缺点也是有比较多的。
其问题主要存在于卫生/洁净度及生产稳定性等方面。
1、二手木托盘还有木材易受潮、发霉、虫蛀，且无法清洗。此外，其表面木屑脱落及螺钉锈蚀的问题也无法克服。
2、由于木材是天然材料，其质量受地域气候等多方面影响，即便是同一批原料，在干湿度、风裂等方面亦难以达到统一标准。
3、木制托盘使用寿命较短，常规使用下周转次数约在200—300次。
据我了解，这边的二手木材回收有很多的个体户（都是农民工）在经营，其实每个城市都有，只是我们以前没有发现而以，如一个个体户每年可以回收超过1000吨的木材，而广州这边我了解到有大概300家这样的回收个体户，那么统计起来，他们每年可以让30万吨木材回收再利用，这还是不完全统计，因此这是一个很的数字了。那我国城市这么多，每个城市的量都加起来，估计每年有上千万吨的木材可以得以重复利用，而这得减少多少的树木砍伐啊。
木托盘在物流包装行业起着非常大的作用,木托盘的材料主要是木制材料为主，木制材料有着很多优点和缺点，木制材料优点是使用方便而且成本较低。木托盘材料的缺点 是会使用大量木头导致国内木材的大量砍伐。同时由于木制材料中经常含有害虫导致在物流包装时候木材运往国外影响其他 的害虫增加。为了避免这一现象现在的木托盘都是需要进行熏蒸处理。这样可以保证木托盘上的害虫减少。但是木托盘总有 会被替代的，现在越来越多的人选择塑料托盘来作为包装的 了。
纸质包装箱内外层都是选用纸质板材制成的，所以不仅不会污染环境，并且也能够收回使用，大大降低了本钱，顶板和侧板是选用楞板制成的，底板用瓦楞纸复合板或蜂窝纸板制成，正因为是纸制品，其巩固刚烈功能相对较差，不能接受高强度的工作环境，易碎裂。
综上所述，实木托盘较之别的包装材质有着自个有优势，尽管密封性和缓冲功能关于实木托盘包装而言尚有缺憾，可是关于大型包装和长时间储存包装而言，实木托盘包装有着其特有的优势。此外，实木托盘包装资料作为一种环境协调性资料,具有绿色包装资料的特点,将会遭到大家不断增加实木托盘的重视。