产地不同：普通鸭蛋大部分都是在内陆小湖小泊中人工养殖的鸭子产的蛋，海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋。
喂食饲料不同：普通鸭蛋一般以人工饲料或者湖中的淡水鱼为食，为了保证其质量以及产蛋的数量，一般主要还是人工饲料为主，而海鸭蛋是由海边城市天然放养的海鸭所产的蛋，其主要以海中的小鱼、小虾、小螺以及小蟹为食，无添加，这种海鸭十分肥美。
营养价值不同：食用海鸭蛋对人体多么有益，关键是其营养不仅丰富，但是其胆固醇含量还只是鸡蛋的50%，而普通鸭蛋营养价值就比海鸭蛋营养价值就逊色很多。
禽类蛋的蛋黄中本来含油量就比较高，但由于是以乳化(洗碗的洗洁精就是油脂的乳化剂)状态存在，所以和我们一般见到的“油”不一样。经过长时间的腌制，乳化状态的油的性状发生改变，所以当我们切开咸鸭蛋，就会有油流出来。所以，油多的咸鸭蛋并不是腌制的好，大部分是因为选用了含油量高的鸭蛋而造成的。
高渗溶液中氯化钠等进入鸭蛋中，鸭蛋中的氯化钠成分会越来越多，达到和外界水平一致。而蛋黄中的成分则会在盐和其他成分的作用下发生变化，只要经过足够长的时间，腌鸭蛋也都会出油的。
怎样腌制咸鸭蛋？
1、首先我们准备鸭蛋、盐、八角、白酒、清水，先将鸭蛋清洗后擦干，然后将准备腌制鸭蛋的坛子洗干净，倒点白酒杀杀菌，之后再擦干；
2、找个大点的水盆，倒入白酒，把鸭蛋放进去泡20分钟左右，然后捞出来沥干表面的白酒，一个一个装进坛子里；（白酒就是让鸭蛋“富到流油”的关键，并且有了白酒，鸭蛋的口感会更细腻）
3、烧开一锅水，放入八角、盐，不停地搅拌至融化，关火时再加一勺白酒，搅匀，等待水冷却；
4、将冷却的水倒入装好鸭蛋的坛子里，没过鸭蛋，封上保鲜膜，盖盖子，然后把坛子放到阴凉地，避免阳光照射，等待20-25天即可食用。