虽然相关规范对消毒后内镜的储存时间没有做出具体要求，一些专业组织给出的建议也不一致，但WS507-2016《软式内镜清洗消毒技术规范》明确规定:每日诊疗前，应对当日拟使用的消毒内镜进行再次消毒、终末漂洗及干燥后方可用于患者诊疗。
内镜消毒干燥后悬挂于储镜柜(库)中。WS507-2016《软式内镜清洗消毒技术规范》中指出，内镜干燥后应储存于内镜与附件储存柜内，镜体应悬挂，弯角固定钮和阀门单独储存。内镜与附件储存柜应每周清洁消毒一次，遇到污染时应随时清洁消毒。储存柜内表面应光滑、无缝隙，便于清洁和消毒，通风良好且应保持干燥，通风良好有利于内镜的持续干燥，从而减少由于潮湿环境造成的微生物污染发生。