土壤质量状况分析。利用普查取得的土壤理化和生物性状、剖面性状和利用情况等基础数据，开展土壤质量分析，摸清土壤资源质量现状。
土壤数据库构建。建立标准化、规范化的土壤数据库，包括空间数据库和属性数据库。空间数据库包括土壤类型图、采样点点位图、剖面分布图、养分分布图、土壤质量图、土壤利用适宜性评价图、地形地貌图、道路和水系图等。属性数据库包括土壤性状、土壤障碍及退化、土壤利用等指标，土壤利用类型数量、质量等数据。有条件的地方可以建立土壤数据管理中心，对数据成果进行汇总管理。
数据汇总。按照统一的数据库标准，建立分级数据库。采用内外业一体化数据采集建库机制和移动互联网技术，以省为单位进行数据汇总，形成集属性、文档、图件、影像为一体的土壤三普数据库。
质量校核。统一技术规程，采用土壤三普工作平台开展全程管控，建立和地方抽查复核和评估制度。外业调查采样实行“***”航迹管理，样点样品编码溯源；测试化验质量控制采用标样、平行样、盲样、飞行检查等手段，分级审核测试数据；数据审核采用设定指标阈值等方法进行质控。
成果汇总。采用现代统计方法，对土壤性状、土壤退化与障碍、土壤利用等数据进行分析，利用数字土壤模型等方法进行数字土壤制图，进行成果凝练与总结，阶段成果分段验收。
外业调查与采样技术规范土壤普查办，组织编写《土壤外业调查与采样技术规范》，明确样点现场确认、样点信息调查与填报、样品采集、样品包装与寄送等外业调查采样工作。
各省级土壤普查办，落实本技术规范，制定适合本区域的外业调查与采样技术规范，负责组织开展本区域的外业调查采样工作。
各省负责组织开展外业调查与采样工作。各省级土壤普查办根据土壤普查办统一布设的样点和调查任务，负责组建调查采样队（调查采样队人员组成中至少有1位通过省级土壤普查办统一组织培训，并获得培训证书和1名县级相关技术人员），制定外业调查采样计划，按照统一的《土壤外业调查与采样技术规范》，开展样点现场确认、样点信息调查与填报、样品采集、样品包装与寄送等外业调查采样培训，落实外业调查采样的工作进度。
其中采集土壤剖面样点的调查采样队，须由熟悉土壤分类与制图的带队，重点负责挖掘土壤剖面、观察与记载剖面形态、采集剖面土壤样品与标本，开展土壤类型校核完善与边界勾绘等。