能源审计主要包括策划与组织、现场诊断、现状及节能分析、报告编写及定稿四个流程。1、策划与组织：策划与组织是开展能源审计工作的关键阶段，通过沟通、培训使企业负责人、设备管理人员及员工对能源审计及能源管理工作形成初步认识，消除思想上和观念上的障碍；了解用能单位能源审计的工作内容、要求以及工作程序。取得高层的支持和参与，组建能源审计小组，制订能源审计工作计划。初步能源审计一方面可以找出明显的节能潜力以及在短期内就可以提高能源效率的简单措施，同时，也为下一步全方面能源审计奠定基础。
编制审计报告：根据调阅的企业能源消耗数据、能源管理现状、能源审汁现场诊断及数据分析结果，分析用能单位的用能薄弱环节，分析节能潜力，并在技术经济可行性分析的基础上提出系统的节能改造方案经过与用能单位协商、讨论，终完成报告，报告中应该包括改善能源管理的措施，运行维护的建议，低成本无成本节能项目、重大项目的改善方案，以及各能源绩效参数的计算结果及分析。企业能源管理(管理节能)诊断分析评价方法：(1)合理组织生产。
分层嵌入原理：分层嵌入原理是指在能源审计中，能源利用流程的四个环节（购入贮存、加工转换、输送分配、至终使用）都要嵌入能源利用效率低和能源浪费在哪里产生、为什么会产生能源利用效率低和能源浪费、如何解决能源利用效率低和能源浪费这三个层次，在每一个层次中都要嵌入能源、技术工艺、设备、过程控制、管理、员工、产品、废弃能这八个方面。在能源审计的各个阶段都要都要从四个环节出发，利用三个层次，从八个方面入手弄清位置，找准原因，解决问题。因此，现场诊断阶段，需针对电力参数、环境参数、温度压力参数、流量参数等进行检测，一般需要配置相应的便携式能效诊断仪器。