隐孢子虫和贾第鞭毛虫的纯化—磁分离技术:1999年美国在EPA1623方法中规定利用IMS{Immuo Magnetic Separation}磁分离技术Dynabeads来分选检测饮用水中隐孢子虫卵囊和贾第鞭毛虫孢囊，其原理是：利用带有特异性的磁珠与样品中的目标产物G/C特异性抗原相结合，在磁场中搞笑选择中分离。
3、IFA染色&镜检
待井形载玻片的纯化液干后，用NaOH中和井形载玻片上样品，再用Dynal公司的Aqua-GloTMG/C染色试剂盒，将卵囊和孢囊在井形载玻片上用磁荧光标记的单性和DAPI溶液着色后，盖上盖玻片。然后，OLYMPUS荧光和差分干涉相衬（DIC）显微镜对着色样本进行检测。观察样本，对符合卵囊和孢囊大小、外形、荧光特性的对象进行定性、定量分析。
常规水质检测方法
1加热和氧化剂分解方法
该方法主要使用有机化合物，包括有机物和分解过程中产生的二氧化碳的含量或分解过程中消耗的氧气的含量作为水质检测的指标。
2 温度和中和方法
其中，温度是常用的水质检测方法之一。 因为水的许多物理特性和水中发生的化学过程都与温度密切相关。 不同水源温度不同，但地表温度与当地气候条件有关，其变化范围为1-30℃，而海水温度变化范围为2-30℃； 中和方法主要包括水体的酸碱度。 进行水质检测。
贾第鞭毛虫通常会导致慢性虚弱的腹泻，体重减轻和吸收不良。饮用被污染的水可能会导致贾第鞭毛虫病。传播也通过直接接触而发生，尤其是与无症状的携带者接触以及食物污染。
隐孢子虫在世界. 上大多数地区,它与腹泻病有关，是旅行者腹泻的常见原因。该疾病是由厚壁卵囊传播的，该卵囊对普通消毒剂和饮用水的常规氯化反应具有显着抵抗力。