1.苦草为基生茎，入泥深度不能超过其茎；
2.黑藻、金鱼藻、伊乐藻等不定根（须根），根据季节或拌土撒入水体，或株体部分插入泥底即可。
3.眼子菜、狐尾藻等植物，尽量将植物茎部横铺 10-20 cm 浅埋入泥，这样水草发芽生长起来可以成片（此类水草茎节可发新株）。
以上常用沉水植物中，单一矮苦草，或矮苦草和黑藻的组合使用在很多景观水体中具有十分的治理效果（非生态意义）。矮苦草一般一平种植 200 株左右，在 20-35 摄氏度区间，大概 1-2 个月基本能长满水底（生长过程中，水透明度需能看见矮苦草叶片）。其他水草点缀种植即可（实际密度根据环境和成本考虑，但一般一丛保证植物数量在 20 棵以上，减少粗放施工导致的根茎受损）。
0种沉水植物：狐尾藻、光叶眼子菜、黑藻、苦草、黑藻、小茨藻、茨藻、金鱼藻、狸藻、马来眼子菜、角果藻、杉叶藻、水车前、水毛茛、穗花狐尾藻、伊乐藻、菹草、穿叶眼子菜、微齿眼子菜、篦齿眼子菜。
沉水植物是指根生于泥中，茎、叶全部沉于水中的水生植物。其根茎不发达，个部位都能吸收水分和养分，可以在水中进体交换，一般都是长期浸没在水中，只在开花时，花茎和花会露出水面。
在实际的工程项目中，常见的挺水植物主要为香蒲、美人蕉、鸢尾、、再力花、梭鱼草、芦苇、芦竹、慈菇、荷花等，品种很多，种植简单；挺水植物的栽种与园林绿化苗木栽种一样，裸根苗直接挖坑埋入泥内，带盆苗去掉外盆脚踩入泥即可，底泥营养差的可适当施加基肥。但现阶段对水生态修复工程而言，挺水植物的选用要考虑以 下 5 点：
1.根据当地气候特征，选用当地有的物种，保证成活率和降低成本。
2.根据景观要求和季节变化合理搭配植物品种和密度，栽种前充分考虑各品种的花期和叶相。
3.若项目底泥有重金属或持久性有机物质，不建议栽种挺水植物；确需种植，需定期收割和安全处理，避免造成污染放大。
4.面源污染较多的区域尽量多栽种低矮叶片密集的挺水植物。
5.芦苇、香蒲等极易泛滥的挺水植物，栽种时做控根处理。