荧光显微镜应用于水质“两虫”检测人们常说水是生命的源泉，可见饮用水质量的优劣直接关乎人类健康。常规的饮用水监测范畴包含色度、余氯、杂质、细菌数等物理、化学以及细菌指标的检测，除此之外，贾第鞭毛虫（Giardia）和隐孢子虫（Cryptosporidium）（简称“两虫”）是主要的导致人体腹泻的两种水源性原生动物，是影响水质不容忽视的重要因素，近年来水质监测领域对两虫的检测越来越重视。“两虫”主要通过被污染的饮用水或食物人类，其卵囊或孢囊个体微小、致病剂量低、抵抗环境压力强、方式简单、发流行且呈性分布，严重危害水质。人类对“两虫”疾病普遍易感，者多表现为急、、低热甚至等临床症状，绝大多数对其ZL无效，抵抗主要依赖于人体自身的。
水质检测对于人们日常生活的重要性--体现在对于供水管网水质检测的过程中
为确保人们在日常生活中能够安全用水，检测人员应对于水生产、加工、运输过程中的每个环节进行监管、跟踪，确保安全后将水通过供水管道运送到千家万户。这时也并不能保证每个用户所使用水的品质完全符合国家规定标准，生活用水是一种极为特殊的商品，比如生活用水在到达用户家的水被使用之前，是经过很多个供水管道来进行传输，生活用水在进行运送的过程中，在一定程度上会出现二次污染的问题。水的品质不达标存在多种原因，比如供水管道的损坏、管道质量较差或老化、供水设施影响与居民用水从而导致污染发生等等。在生活用水出厂之后，将立即通过供水管道运送出去，在这一过程中存在不可逆性的特点。同时，生活用水作为一种不可退换产品，与其他产品有明显的不同，它能够直接反映出供水管道质量的优劣。由上文得知，要判断生活用水的水质优劣就需要检测人员对于管网的各个部分尤其是末梢部位的水质进行抽样分析。因国家对于饮用水的标准有着极为严格的规定。因此在被选择的采样点中，要着重考虑将一定的点设置在出厂水、供水管道的末梢、供水管网陈旧的部分等水源容易受到污染的地方。根据计算供水人口的密度以及城市地下供水网的分布进行分配采样点，并考虑到各地区的情况不同进行科、合理的调整分配。根据规定，网管的取样分析和监控检测需每周进行至少一次，供水网管的末梢检测则需要每月进行一次，从而达到保证居民日常生活、饮用水的水质安全的结果。
两虫检测方法：
滤膜浓缩/密度梯度分离荧光法
范围：
生活饮用水和水源水中贾第鞭毛虫、隐孢子虫的测定。
原理：
首先通过微孔滤膜法过滤水样浓缩样品或加入氯化钙溶液和碳酸氢钠溶液形成碳酸钙沉淀浓缩样品，将浓缩后的样品通过密度梯度离心进行分离纯化，然后将纯化后的样品经荧光染色，通过荧光显微镜对贾第鞭毛虫孢囊、隐孢子虫卵囊进行定性分析和定量检测；具有高藻、高有机质和高絮凝剂含量的水源水样本应先进行前期处理。
两虫检测自动识别系统在卫生疾控、供水系统、第三方检测、环境监测等领域具有广阔应用前景，能够为我国从到供水安全保障中两虫防控提供支持，解决我国饮用水两虫检测过程中检测成本高、人工识别存在主观性、设备及耗材依赖进口等诸多问题。
水源水质检测
水源的质量是影响用水质量的来源。在水厂生产过程中，要密切监测水质变化，及时准确地掌握水源水质特征，便于后续处理的及时调整和顺利运行。大多数地下水需要适当处理，即使经过特殊处理，以达到饮用水或工业用水标准。其原因如下：一是地层中的矿物在形成过程中溶解，致使水中某些元素的溶解量超过允许浓度；二是人类活动造成地下水污染，造成铁、锰超标。铁、锰是人体必需的微量元素，水质中含有适量的铁和锰，对人体有益且无害；但人体长期摄入过量的铁和锰，会引起慢性毒，诱发某些疾病。